Agens/analyse
Prøvene blir initialt analysert med PCR med tanke på følgende tarmpatogene E. coli-typer/gener:
Enterohemoragisk Escherichia coli (EHEC)
- Shigatoxin 1 (stx1) - DNA
- Shigatoxin 2 (stx2) - DNA
- Intimin-gen (eaeA) - DNA
Enteroinvasiv Escherichia coli (EIEC)
- ipaH-DNA
Enteropatogen Escherichia coli (EPEC)
- Intimin-gen (eaeA) - DNA
Enterotoksinogen Escherichia coli (ETEC)
- Varmelabile (lt) eller varmestabile (st) enterotoksiner - DNA
Analysen utføres ved
Bakteriologisk enhet, tlf. 75 57 83 30
Indikasjon
Blodig diaré
Mistanke om hemolytisk uremisk syndrom (HUS)
Kronisk diaré hos barn < 5 år
Diaré etter opphold i utviklingsland
Smitteoppsporing/kartlegging ved utbrudd
Sannynlig infeksjonsutløst diaré hos sykehjemspasienter eller sterkt immunsupprimerte
Hensikt
Prøvemateriale/prøvemengde
Feces på FecalSwab
Prøvetaking/prøvebehandling/forsendelse
Medium: FecalSwab
Metode:
1) Prøvepenselen dyppes i avføring og vris rundt
2) Penselen plasseres nederst i transportrøret (i kontakt med mediet)
3) Penselen knekkes i brekkpunktet før korken skrus på
Analyser kan ikke utføres i prøver som er mer enn 3 dager gamle ved ankomst laboratoriet.
Fiksering/oppbevaring
Oppbevares i kjøleskap frem til forsendelse
Holdbarhet
Analyser kan ikke utføres i prøver som er mer enn 3 dager gamle ved ankomst laboratoriet.
Analysemetode
PCR/dyrkning
Prøver som er PCR-positive vil i enkelte tilfeller måtte dyrkes og sendes til nærmere undersøkelse og karakterisering ved Folkehelseinstituttet (FHI).
Tolkning
Enterohemoragisk E. coli (EHEC) defineres som de humanpatogene variantene av shigatoksinproduserende E. coli (STEC). Infeksjon gir som regel selvbegrensende gastroenteritt, men i 10-15% av tilfellene kan også livstruende sykdom forårsakes, eks. hemolytisk uremisk syndrom (HUS). Barn og eldre/immunsupprimerte er spesielt utsatte. Smitte skjer fekal-oralt og forekommer som regel i forbindelse med inntak av kontaminert mat eller drikke.
Enteroinvasiv E. coli (EIEC) gir vanligvis mild diaré, men enkelte pasienter kan få dysenteriliknende bilde med pussholdig, av og til blodig diaré, kraftige abdominalsmerter og feber. Bakteriene invaderer tarmepitelcellene og sprer seg videre til nærliggende epitelceller. Dette gir opphav til en akutt betennelsesreaksjon i tarmslimhinnen, som resulterer i blødninger og nekrose av epitelet.
Enteropatogen Escherichia coli (EPEC) gir vanligvis vandig diaré med feber og ser ut til å kunne være en av meget få bakterielle årsaker til kronisk spedbarnsdiaré. EPEC kan videre deles inn i typisk (tEPEC) atypisk (aEPEC).
Globalt sett er tEPEC en av de hyppigste årsaker til bakterielle gastroenteritter som i lavinntektsland ikke bare rammer småbarn, men også voksne.
aEPEC er en heterogen gruppe bakterier med usikker assosiasjon til diaré, differensiering mellom EHEC som har mistet sine toksin-gener og aEPEC som årsak til diaré eller som del av normal tarmflora er svært vanskelig. Kliniske opplysninger er derfor avgjørende for hvordan laboratoriet behandler prøven videre.
Enterotoksinogen Escherichia coli (ETEC) er den vanligste årsaken til diaré hos barn i lavinnkomstland og isoleres ofte fra pasienter med «turistdiaré». I Norge er også matbårne ETEC-infeksjoner blitt mer vanlig de senere år.
For mer informasjon se
E.coli-enteritt, veileder for helsepersonell
Analyseringsintervall/hyppighet
Daglig
Forventet svartid
Negative prøver: 1 dag.
Positive prøver: 1 dag.
Dersom en prøve (spesielt EHEC, EPEC og EIEC) må sendes Folkehelseinstituttet for nærmere undersøkelser, foreligger det endelige svaret vanligvis etter 2-3 uker.
Foreløpig svar ved funn av genmateriale fra EHEC, EPEC og EIEC vil basert på kliniske opplysninger og pasientens alder meddeles rekvirent per telefon. Ev. behov for kontrollprøver, sykemelding fra jobb/skole, oppfølging av familiemedlemmer/nærkontakter og videre varsling må vurderes i hvert enkelt tilfelle.
Indikasjoner, tolkning og referanser
Merknader
Akkreditering
Analysen er akkreditert i henhold til ISO 15189:2012